Pada tanggal 21 Agustus 1991 dengan Akta Notaris Syawal Sutan Diatas Nomor 87 berdirilah sebuah Yayasan yang dinamakan Yayasan Kesejahteraan dan Pendidikan Payung Negeri Pekanbaru. Maksud dan tujuan pendirian Yayasan ini adalah untuk meningkatkan pelayanan kesehatan dan kesejahteraan masyarakat. Salah satu usaha dari Yayasan tersebut adalah mendirikan Lembaga Kesehatan antara lain Akademi Keperawatan, Akademi Kebidanan, Si Keperawatan dan S1 Kesehatan Masyarakat.Menghadapi era global, penyedia pelayanan kesehatan nasional akan menghadapi pesaing dari penyediaan pelayanan kesehatan asing yang akan masuk ke Indonesia termasuk tenaga keperawatan, kebidanan dan tenaga kesehatan masyarakat. Kemajuan yang pesat dalam ilmu pengetahuan dibidang pelayanan medis belum diikuti oleh meningkatnya kualitas pelayanan kesehatan baik pelayanan keperawatan, kebidanan maupun pelayanan kesehatan masyarakat yang merupakan mitra pelayanan kesehatan secara menyeluruh.

Pada Bulan Maret 2008 keluar surat keputusan Menteri Pendidikan Nasional Republik Indonesia Nomor : 47/D/0/2008 tentang penggabungan AKPER Payung Negeri dan AKBID Payung Negeri Pekanbaru menjadi Sekolah Tinggi Ilmu Kesehatan (STIKES) Payung Negeri Pekanbaru. Maka semenjak STIKes Payung Negeri berdiri pada bulan maret 2008 masing - masing Program Studi tidak lagi berdiri sendiri tetapi sudah tergabung dalam STIKes Payung Negeri.Secara umum tujuan pendirian STIKes Payung Negeri adalah membentuk tenaga kesehatan yang professional, bertakwa kepada tuhan yang maha esa, memiliki rasa tanggung jawab atas sesama umat manusia untuk kesejahteraan masyarakat luas serta berkemampuan melaksanakan pengembangan Dalam perkembangannya pada tanggal 18 April 2015, berdirilah program studi Profesi Ners melalui keputusan menteri pendidikan nasional Republik Indonesia No. 130/E/0/2015 tentang izin penyelenggaraan prodi profesi ners pada STIKes Payung Negeri Pekanbaru.